关于dom4j、dom如何清理内存中已经加载的xml树

目前在使用DOM和dom4j对XML文件进行增删改查，如果我在同一个线程中做多次增删改操作，如何保证DOM内存同步和物理文件同步？又如何清理在内存中已加载的数据？
问题补充：
你说的这种就是很单纯的在一个线程中执行所有的操作，如果我是在单线程中操作，每做一次增删改查的一种，我都要保存到文件中去，如：
第一次：增加，保存文件。
第二次：删除，保存文件。
.....
问题补充：
我现在就是每次都重新读取这个文件生成Document对象，可是我怀疑他还是在内存中去读取的，所以想有个清理在内存中已加载的数据。
问题补充：
每次保存到文件后用Document = null;也不行？？
这样做也不行。
问题补充：
这个需要确认一下，另外，如果真是从内存中读的话，你把内存中清理了，但是document还没有被GC，能保证它不会给你读个空的XML出来吗？
现在就是要把内存先进行清理，确认这部是否可行，可我不知道如何进行清理
问题补充：
呵呵，不知道是程序上的原因还是其它什么原因，我用W3C的DOM也是这样。期待....
问题补充：
终于经过努力找到了答案，就是在用W3C DOM，DOM4J,JDOM对xml文件做操作时（增删改）不要放在在tomcat 的webapps 下。
哎，即郁闷又显高兴！