小儿脾胃疾病是临床外感病以外最常见的疾病，小儿脾常不足，喂养上应注意乳贵有时，食贵有节，若饮食不知节制，或喂养不当，过食肥甘、甜腻、冷饮及不易消化等食物，致伤脾胃生积滞之病者甚为常见，如胃痛、腹痛、厌食、腹泻、食积发热等症。脾胃损伤，内生积滞，或食积化热，或有肺脾气虚，表虚不固，又易兼感六淫时邪，故民间有“停食”“着凉”之说。对此类疾病，孔老的治疗很有次第，试述如下。
若脾胃损伤不重，积滞较轻者，仅有食欲不振，脘腹不舒，舌苔白腻，脉尚缓和者，首先是控制饮食，少食肥甘厚味，用药稍佐助消化之品，如焦三仙、炒谷稻芽、鸡内金等，三分治，七分养，以养为主，脾胃自然容易恢复。
积滞再重兼有化热之象者则以保和丸加减；症见食欲不振，恶心频起，呕吐酸腐不化食物，腹痛胀满，按之尤甚，痛即欲便，便后痛减，大便次多，又不消化食物残渣，或大便干燥，或有潮热，夜寐不安，舌苔白厚腻，脉象滑数者，处以保和丸加减：陈皮6g，法半夏6g，云茯苓10g，炒枳壳6g，莱菔子6g，青连翘6g，焦三仙20g，大腹皮6g，鸡内金8g；化热明显者可酌加苇根10g，青竹茹10g。胃痛腹痛者，肝郁气滞者可加理气柔肝之品如香附米6g、广木香4g、炒枳壳6g、杭白芍8g等品；
积滞较重、不欲饮食，大便秘结，腹部胀满，喜食凉物，或发潮热，舌苔黄厚腻，体质尚可者，孔老常处以攻下导滞之方：荆三棱4g，蓬莪术4g，炒二丑各3g、生熟军各3g ，砂仁5g，鸡内金8g。孔老认为，现今的小儿，饮食一般都营养过剩，嗜食肥甘厚味，导致肠胃积滞生热而厌食，有些小儿用一般消导之品，效果不佳，而体质尚实，可任攻下者，可暂用峻利之品以下之，待积滞去而自欲饮食，但攻逐之品只可暂用，中病即止，只要掌握得度，并无损伤脾胃之患，故孔老每用之；
若伤脾较重者，症见面黄肌瘦，不思饮食，倦怠嗜卧，睡时露睛，腹胀，便溏者，可酌加健脾益气之品，如党参8g、山药10g、白术8g、茯苓10g、莲子8g、扁豆8g等品，但不可补之过甚，并佐以藿香8g、砂仁5g、木香5g等理气之品，使补而不滞，辅以饮食调理，自能建功；
若病后伤津，或过食辛燥肥甘，蕴热伤津等导致胃阴不足，亦可见食欲不振，症见面色萎黄，唇口干燥，不欲饮食，大便干燥，小便赤热，肌发枯槁，舌质红而少苔，脉细数者，当处以养胃阴之药，可酌选：霍石斛10g，天花粉10g，肥玉竹10g，南北沙参各10g，麦门冬...